早期的微耕机在旋耕作业中，刀具常常会出现断裂，也出现过刀片伤人事件。微耕机刀具均使用锰钢制作，经久耐磨。另有实用性安全设计，当使用扶手脱手时，机器自动停止行进，可以避免当刀具伤人时机器持续运行加剧伤害。
一些柴油微耕机相对而言机身较重，使用过程中进行转弯时特别吃力。微耕机变速箱经过反复试验与发明，可以实现差速转向功能，转弯时内侧轮停止，外侧轮行进，特别省力，非常适合力气小的老年人或妇女。
使用倒档前必须将油门扭至速，机手站立位置应尽量远离旋耕刀。握倒档把时，换挡杆必须置于空挡位置。换挡时必须先断开离合器；左手握紧离合器手把，右手握紧倒档手把再慢慢松开离合器手把，控制好倒车速度，切忌突然放开离合器手把。当感觉控制不住时可两手同时松开，人向两侧跳出危险区。操作者在作业中如果背对坎边小于一米时，禁止使用倒档。
操作前期有三个准备工作,即选择配套的机器物具;检查传送箱、燃油箱、传送箱里的油料，和水箱中的水位:调整油门、离合器的拉线，还有手扶架高度、耕深和三角皮带等。在我们需要启动微耕机的时候，先在机启动前打开电锁,然后将档位调至空档,并且将水箱开关处调成滴水状态。接下来踩下启动阀，注意认真辨别发动机的运转声音和它排出的颜色，当操作人确定微耕机的发动机正常。