次氯酸水消毒剂对不锈钢无腐蚀作用，对铜、铝、有轻度腐蚀作用，对碳钢有中度腐蚀作用。为避免因长期使用对金属制品造成的伤害，对可能被腐蚀的金属制成的物品消毒后，应根据消毒级别的要求，用自来水或无菌水冲洗。不同浓度或配方的制剂及不同企业生产的产品稳定性有差别；通常，在密闭、避光条件下，恒温54℃存放14d的有效氯下降氯<10% ，指标其常温下有效期为12个月。
传统的消毒液(84消毒液、酒精等)只能进行物体表面消毒，无法进行空气消毒，但是次氯酸消毒液可以，次氯酸消毒剂能通过雾化消毒，空气消毒，有效阻止空气传播病毒。次氯酸水消毒剂的消杀效果：单胞菌等多种常见细菌；对多种真菌、病毒都具有非常好的杀灭效果(杀灭对数值>5.0。次氯酸水消毒剂的杀菌作用包括次氯酸的作用、新生氧作用和氯化作用。次氯酸的氧化作用是含氯消毒剂的主要的杀菌机理。次氯酸水消毒剂在水中形成次氯酸，作用于病菌体蛋白质。
次氯酸水消毒剂的杀菌作用：
由此证实次氯酸有着明显的杀菌作用，并对人体无害。所以次氯酸，水里的细菌，自来水常用 (1L水里通入约0.002g)来杀菌消毒。次氯酸能使染料和有机色质褪色，一般用作漂白剂、氧化剂、除臭剂和消毒剂。在生物学中，次氯酸被嗜中性白细胞(Neutrophil)用来杀灭细菌。它被广泛用于游泳池的含氯消毒剂产品。
有效含氯量100mg/L的次氯酸水消毒剂具有杀灭作用。所以使用方法及范围如下它的适用范围：幼儿园类、机构类、会所类;飞机类、装备类消毒;地铁站、火车站、机场、码头和军事设施;动物护理设施、养殖场等场所进行消毒。
虽然目前次氯酸水消毒剂使用的比较多，具腐蚀性，可致人体灼伤，具有致敏性。使用时应稀释过后再进行对消毒区域消毒，家用洁厕精不可以和84消毒液混用，否则会生成，可能导致。通常使用的84消毒剂浓度高，且富含大量稳定的、极易残留的次氯酸根离子，给环境造成沉重的负担。次氯酸水消毒剂与传统的化学消毒很大的不同，其含有的活性成分性质不稳定，与光、空气以及有机物等接触后，有效成分会逐渐分解，杀菌后氧化还原电位迅速下降，很快分解并还原为普通水，排放对环境没有任何污染，与传统化学消毒剂相比，具有安全、无残留、无污染的特点。