为了维护车间内的高洁净度，车间必须经过定期的自我检测或第三方检测，以确保车间的洁净度达到特定的标准要求，保障车间生产线稳定正常运行。净化工程需要根据医院的实际情况进行合理设计，包括洁净区、半洁净区、非洁净区等不同要求的区域，以确保区域的合理使用。净化工程车间在生产过程中需要对空气质量进行严格控制，一般要求内部空气中的颗粒物浓度、噪音、温度、湿度等参数符合严格标准。
建筑结构要求：车间的建筑结构、地面处理、墙面涂装、天花板等都需要符合要求，以达到良好的密闭性和净化效果。地面清洁控制：保持车间内地面的清洁和干燥舒适，避免在地面积聚尘土和污垢，确保操作环境的干净和安全。需要考虑食品车间净化工程的系统稳定性，包括环境控制系统的运行稳定性、设备选型的稳定性和通风管道的稳定性等。
净化车间材料是净化厂房墙、顶板材一般多采用50mm厚的夹芯彩钢板制造，其特点为美观、刚性强、保温性能好、易施工。圆弧墙角、门、窗框等一般采用氧化铝型材制造地面可采用环氧自流坪地坪或耐磨塑料地板，有防静电要求的，可选用防静电型。采用多档开关控制方式优点是控制简单、成本低，但存在许多缺陷，比如能耗大、不能平滑调速、没有反馈信号、不能实现灵活的组群1控制等。净化车间风机外壳的选择：由于净化车间工程的厂房按照不同的使用要求，会有不同的级别要求，如10级、100级、10000级等，这就使得净化车间工程存在不易克服的问题，而风机过滤器单元(简称FFU)的出现相对解决了这些问题。